东汉朝廷解除党禁，选择贤才，发精兵镇压各地叛乱。
然而东汉朝廷积腐已久，朝廷这些行动并未很快取得效果，黄巾起义仍进行得如火如荼，各地黄巾不仅未有败退迹象，反而越战越勇屡挫官军。
北中郎将卢植率北军五校负责北方战线，与张角带领的黄巾主力周旋趁卢植牵制住了冀州黄巾，朱儁和皇甫嵩各领一军，率五校、三河骑士及刚刚招募到的精兵勇士共四万余人，讨伐颍川黄巾主力。同时，朱儁还上表招募孙坚为佐军司马，孙坚带乡里少年及募得各商旅和淮水、泗水精兵，共千多人出发与朱儁军会合。
江东猛虎孙坚就此走上历史舞台，开始其波澜壮阔的征战生涯。
朱儁和皇甫嵩握重兵讨颍川黄巾，进展却并不顺利。
朱儁与颍川黄巾将领波才交战，被波才击败，朱儁不得不撤退，被波才穷追不舍。皇甫嵩见势不妙，不得不率军与朱儁一同进驻长社县城防守，波才随即率大军围城。被东汉朝廷寄予厚望的讨伐黄巾主力，就这样被围在小小的长社城中，首战失利，又被围城，士气十分低落。
冀州黄巾、颍川与朝廷讨伐部队大打出手，三大主力之一的汝南黄巾，自然也不会闲着。东汉朝廷暂时分不出兵力对付他们，汝南黄巾掌握主动，庚子日，黄巾将领张曼成攻杀南阳郡守褚贡，声援张角！随后不久，汝南黄巾又在邵陵打败太守赵谦，广阳黄巾杀死幽州刺史郭勋和太守刘卫。
各地黄巾军连战连捷，屡有建树，士气如虹。
黄巾军不断高歌猛进，反衬出朝廷官军的失意与落魄，洛阳为之震动。
势力基本按着剧本在各自轨道上推进，玩家间的对决也欲演欲烈。
神州大地，到处都是玩家势力活跃的身影，每时每刻都有战斗在发生。
随着大量自由玩家失去仅有的基础功勋，杀之无益，各玩家势力间的战斗，越来越集中地围绕着参战领地进行。自由玩家等级还比较低，单独由玩家军团组织发起对敌对领地的攻击，基本以失败收场，军团玩家多次吃亏后，变得越来越有经验，他们多会拉着本阵营领主一同出征。
领主部队对抗领主部队，自由玩家则作为偏师或战场辅助者形象出现，获胜后，前者可以得到大量人口和人才，后者则获得功勋，大家各取所需。
敌对阵营领主出兵，通常又会引发本阵营自由玩家积极回应，有领主部队地方就有功勋，貌似这是游戏中的常识。对一个玩家领地发起的攻击，往往引发该地区两大阵营玩家大火拼。
围魏救赵、围点打援、声东击西、里应外合
中国古老的兵法被玩家们运用的出神入化。
玩家选择阵营具有不确定性，有些县城加入东汉阵营的势力更多一些，譬如垫江，所有参战领地都在东汉阵营有些县城则是黄巾阵营更加强大，譬如孤城万仞所在的充国县，万仞领联合其他黄巾领主，第一时间消灭充国县唯一的东汉领地后，剩下两个中立领地感受到强烈危机，在战役报名截止时间之前，一个倒入黄巾阵营，另一个则放弃战役保持中立，故充国县已无东汉领主。